根據最新的杭州公積金貸款政策，房齡超過20年的二手房在申請公積金貸款時，首付比例和貸款條件如下：

一、首付比例

　　首套房：房齡超過20年的二手房，公積金貸款的首付比例不低于 40%。

　　二套房：若職工家庭名下已擁有一套住房或無住房但有住房貸款記錄的，購買房齡超過20年的二手房，公積金貸款的首付比例不低于 60%。

二、貸款年限

　　貸款期限最長不超過 30年，且房齡加上貸款期限合計不超過 70年。

　　例如，如果二手房的房齡為25年，則貸款期限最長為 45年 - 25年 = 20年。

三、貸款利率

　　首套住房公積金貸款利率按同期住房公積金貸款基準利率執行。

　　二套房公積金貸款利率按同期住房公積金貸款基準利率的 1.1倍 執行。

四、其他注意事項

　　購買二手房時，房產代理中介公司需向公積金中心備案，且在合同簽訂（付款方式為公積金貸款或公積金商業組合貸款）、支付首付款后，辦理房產交易過戶手續前，提出公積金貸款申請。

　　職工家庭名下擁有兩套及以上住房或未結清住房公積金貸款的，不得申請住房公積金貸款。

　　綜上所述，房齡超過20年的二手房在申請公積金貸款時，首付比例較高，貸款年限有限制，但利率仍按基準利率執行。